2016年5月，科技部國際合作司根據《國家國際科技合作基地管理辦法》、《國家國際科技合作基地評估辦法（試行）》的要求，組織專家開始對2009-2011年間認定的全國135家國際科技合作基地進行評估。12月9日，科技部國際合作司公布了評估結果，其中依托黃海水產研究所建設的“海洋漁業國際科技合作基地”評估結果為“良好”。

“海洋漁業國際科技合作基地”于2010年被科技部國際合作司認定為國家國際科技合作基地。基地授牌以來，黃海所以基地為依托，著力推進海洋漁業科技的國際合作工作，充分利用世界動物衛生組織（OIE）白斑綜合征參考實驗室、OIE傳染性皮下和造血組織壞死病參考實驗室、NACA水生動物健康區域資源中心、中韓漁業聯合研究中心、中-美魚類功能基因組聯合開放實驗室等國際合作平臺，不斷拓寬國際合作渠道，打造全方位、多渠道、多領域、多層次、高水平的國際科技合作與交流的平臺，有效提升我國海洋漁業科技自主創新能力，推動漁業產業轉型升級，也加強了我國海洋漁業科技的對外影響力和國際話語權，對我國海洋漁業科技國際合作發揮了重要的引領和示范作用。